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荧光定量PCR(RNA质量检测)实验步骤

添加日期:2015年10月28日 关键字: 点击次数:648 次

导读:

荧光定量PCR(RNA质量检测)实验步骤

荧光定量PCRRNA质量检测)实验步骤:

1)紫外吸收法测定

先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度。

① 浓度测定

A260下读值为1表示40 μg RNA/ml。样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260 ×稀释倍数× 40 μg/ml。具体计算如下:

RNA溶于40 μl DEPC水中,取5ul1:100稀释至495μlTE中,测得A260 = 0.21

RNA 浓度= 0.21 ×100 ×40 μg/ml = 840 μg/ml 或 0.84 μg/μl

5ul用来测量以后,剩余样品RNA35 μl,剩余RNA总量为:

35 μ× 0.84 μg/μl = 29.4 μg

②纯度检测

RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.82.1

2)变性琼脂糖凝胶电泳测定

①制胶

1g琼脂糖溶于72ml水中,冷却至60℃,10 ml10× MOPS电泳缓冲液和18 ml37% 甲醛溶液(12.3 M)

10×MOPS电泳缓冲液

浓度 成分

0.4M MOPSpH 7.0

0.1M 乙酸钠

0.01M EDTA

灌制凝胶板,预留加样孔至少可以加入25 μl溶液。胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1×MOPS电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米。

②准备RNA样品

3μgRNA,加3倍体积的甲醛上样染液,加EB于甲醛上样染液中至终浓度为10μg/ml。加热至70℃孵育15分钟使样品变性。

③电泳

上样前凝胶须预电泳5min,随后将样品加入上样孔。56V/cm电压下2h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少23cm

④紫外透射光下观察并拍照

28S18S核糖体RNA的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍。还有可能观察到一个更小稍微扩散的带,它由低分子量的RNAtRNA5S核糖体RNA)组成。在18S28S核糖体带之间可以看到一片弥散的EB染色物质,可能是由mRNA和其它异型RNA组成。RNA制备过程中如果出现DNA污染,将会在28S核糖体RNA带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,RNA的降解表现为核糖体RNA带的弥散。用数码照相机拍下电泳结果。

美国life荧光定量PCR:http://www.njgc17.com/product_2213_872.html

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